Stagiaire de recherche académique en Bio-informatique et Génomique

Description du poste

Dans le cadre de sa mission de formation et d’encadrement, le Centre Pasteur du Cameroun souhaite accueillir un(e) étudiant(e) de nationalité camerounaise préparant un diplôme de Master II. L’intéressé(e) travaillera au sein du Service de Virologie / plateforme Génomique sous la direction du Dr Delia Doreen DJUICY dans le cadre des projets de recherche sur MPOX. Thématique de recherche : - Mise en place, optimisation et automatisation de pipelines bioinformatiques pour l’analyse des données de séquençage haut débit (Illumina et Oxford Nanopore) appliquées à la surveillance génomique et à la phylogénie des pathogènes émergents (virus Mpox et autres virus d’intérêt en santé publique).

Exigences

• Étudiant(e) inscrit(e) en Master II en Informatique/Data Science, Bio-mathématiques/Bio-statistiques, ou en Biochimie/Biologie Moléculaire/Biotechnologies
• Maîtrise de l’environnement Linux/Unix et de la ligne de commande (obligatoire)
• Bonnes connaissances en Python et/ou R, Shell/Bash
• Intérêt marqué pour la biologie moléculaire, la virologie et la santé publique
• Autonomie, rigueur scientifique, esprit d’analyse et capacité à travailler en équipe multidisciplinaire
• Bonne capacité de rédaction scientifique et maîtrise de l’anglais technique
• Un plus : Expérience ou connaissance préalable des outils de bioinformatique (BWA, Samtools, BLAST, FastQC) ou des gestionnaires de workflows (Snakemake, Nextflow)

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